24 февраля 1993 года постановлением Верховного Совета РФ № 4543-I был образован Федеральный фонд обязательного медицинского страхования (ФОМС). Один из государственных внебюджетных фондов был создан для финансирования медицинского обслуживания граждан России.
Система обязательного медицинского страхования призвана обеспечить бесплатной медицинской помощью граждан РФ в рамках утвержденной программы государственных гарантий. Финансовые средства формируются за счет отчислений страхователей.
Одним из первых в системе обязательного медицинского страхования был создан Новосибирский фонд ОМС. 8 июля 1992 года Областной Совет народных депутатов Новосибирской области принял решение о досрочном введении в действие закона «О медицинском страховании граждан в РФ» на территории Новосибирской области, а 7 августа 1992 года вышло Постановление №266 Главы Администрации Новосибирской области о выполнении этого решения. В результате, 15 августа 1992 года был образован Новосибирский фонд ОМС.
С 1993 года закон «О медицинском страховании граждан в РФ», который сформулировал концептуальные основы обязательного медицинского страхования в Российской Федерации и его организационную модель, вступил в силу на всей территории страны.
Важной вехой в развитии системы ОМС стало принятие базовых нормативных актов - Федерального закона от 29.11.2010 № 326-ФЗ «Об обязательном медицинском страховании в Российской Федерации» и Приказа от 28.02. 2011 № 158н «Об утверждении Правил обязательного медицинского страхования». В качестве субъектов и участников обязательного медицинского страхования Законом определены: застрахованные лица, страхователи, Федеральный фонд обязательного медицинского страхования, территориальные фонды, страховые медицинские организации, медицинские организации.
Помимо финансовой функции на Территориальный фонд возложены задачи по контролю объемов, сроков, качества и условий предоставления медицинской помощи по ОМС, защите и контролю обеспечения прав граждан в сфере обязательного медицинского страхования.